時值幕末。那是憂心日本的未來，遵循各自的信念奮勇前進的志士們燃燒靈魂的時代。長州的風雲人物高杉晉作和搭檔桂小五郎一起，試圖潛入德川慶喜率領的幕府海軍船艦。目標是據說擁有「操縱時間之力」的傳說秘寶「時辰儀」。高杉耳聞正是幕府要將那股力量據為己用，「那種做法太無趣了！」於是他企圖破壞時辰儀。曾經一度得到時辰儀的高杉等人遭人奪去，追尋到了慶喜所在的京都。然而他在那裡看見的是以異樣姿態君臨天下的「巨城須佐之男」。高杉等人為了跟自己所知的樣貌截然不同的街景、人民的樣子感到不知所措。那裡是由面具將軍無限齋所支配的「另一個幕末」。